81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34170 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  100 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  57.82 
 
 
221 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  60.28 
 
 
215 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  55.39 
 
 
214 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  55.39 
 
 
214 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  52.78 
 
 
216 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  56.19 
 
 
219 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  54.05 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  55.61 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  55.77 
 
 
217 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  54.29 
 
 
204 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  28.77 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  31.22 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  30.29 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  31.4 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  30.62 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  31.55 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  30.64 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  31.78 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  26.54 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  28.45 
 
 
223 aa  72  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  37.07 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.27 
 
 
174 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  27.54 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  29.84 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.98 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  27 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  27 
 
 
274 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  26.78 
 
 
250 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  27.34 
 
 
265 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  27.05 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  25.91 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  27.94 
 
 
197 aa  58.2  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  27.7 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  26.45 
 
 
250 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  24.9 
 
 
250 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  24.9 
 
 
250 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  34.25 
 
 
345 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  30.37 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  24.73 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  26.89 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  24.3 
 
 
261 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  34.29 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  27.6 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  33.07 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  22.79 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  29.52 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  32.81 
 
 
709 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  28.38 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  29.88 
 
 
233 aa  48.5  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  30.09 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  27.23 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  30.14 
 
 
346 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  36.11 
 
 
262 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0807  sporulation related  24.14 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  33.02 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  29.31 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  25 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  38.67 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  27.54 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  39.71 
 
 
259 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  28.82 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  28.51 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  28.51 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  27.2 
 
 
328 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  27.2 
 
 
328 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  29.58 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  32.18 
 
 
735 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  30.23 
 
 
257 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  37.5 
 
 
1888 aa  43.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  30.45 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>