79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1910 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  400  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  33.48 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  35.32 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  30.43 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  28.85 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  31.86 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  34.21 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  32.31 
 
 
280 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  32.31 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  32.88 
 
 
255 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  27.85 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  27.37 
 
 
275 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  37.5 
 
 
285 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  32.34 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  27.52 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  39.73 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  27.52 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  27.08 
 
 
246 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  29.22 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  27.78 
 
 
197 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  43.18 
 
 
328 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  43.18 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  41.67 
 
 
313 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  29.88 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  34.21 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  29.88 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  30.41 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  34.62 
 
 
254 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  29.63 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  28.65 
 
 
194 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  33.33 
 
 
198 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  30 
 
 
288 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  26.92 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  28.19 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  42.62 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  25.12 
 
 
205 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  28.12 
 
 
268 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  35.87 
 
 
249 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  27.88 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  28.05 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  42.25 
 
 
346 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  30.7 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  25.12 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  33.74 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  51.43 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  51.43 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  51.43 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  51.43 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  51.43 
 
 
278 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  51.43 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  25.25 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  51.43 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  32.53 
 
 
360 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  51.43 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  51.43 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  51.43 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  51.43 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  36.07 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  51.43 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  51.43 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  32.53 
 
 
360 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  27.63 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  51.43 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  29.95 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  30.33 
 
 
3333 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  26.55 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  33.06 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  30.08 
 
 
281 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  30.08 
 
 
281 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  31.82 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  27.27 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  33.93 
 
 
332 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  32.39 
 
 
360 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.77 
 
 
1888 aa  42  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  26.96 
 
 
189 aa  41.6  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  36.62 
 
 
224 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>