92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3353 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  82.87 
 
 		 278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  86.01 
 
 		 278 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  86.01 
 
 		 278 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  86.41 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  94.74 
 
 		 282 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  71.23 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  70.42 
 
 		 241 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  70.42 
 
 		 241 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  70.42 
 
 		 241 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  70.42 
 
 		 241 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  70.42 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  70 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  55.59 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  58.17 
 
 		 307 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  94.44 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  80.92 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  56.77 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  39.06 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  38.52 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  34.74 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  35.18 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  36.97 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  32.77 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  36.32 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  33.8 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  32.63 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  29.71 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  29.63 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  33.48 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  30.29 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  35.32 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  33.76 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  28.79 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  26.49 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  29.03 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  32.65 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  32.11 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  27.59 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  58.14 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  32.11 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  28.05 
 
 		 740 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  52.27 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  47.73 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  47.73 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  26.58 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.04 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  25.12 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2218  sporulation domain-containing protein  36.84 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  23.56 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  28.4 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  27.35 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  27.45 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  27.19 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  25.97 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  27.78 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  27.88 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  27.43 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  27.66 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  27.46 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  26.47 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  31.36 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  26.24 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  29.96 
 
 		 218 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  31.79 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  24.04 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  22.86 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  36.07 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  26.78 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  28.22 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  28.14 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  27.16 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  36.07 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  28.78 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  24.69 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  27.1 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6008  hypothetical protein  38.46 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3214  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  26.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0252  sporulation domain-containing protein  38.46 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  26.55 
 
 		 186 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  34.57 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>