54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4379 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
306 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  66.14 
 
 
307 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  68.99 
 
 
312 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  55.73 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  55.73 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  55.73 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  55.73 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  79.22 
 
 
278 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  81.69 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  81.69 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  35.83 
 
 
286 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  33.01 
 
 
245 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  35.57 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  81.82 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  81.82 
 
 
241 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  81.82 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  81.82 
 
 
271 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  72.73 
 
 
285 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  80.26 
 
 
282 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  84.51 
 
 
273 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  36.8 
 
 
215 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  83.1 
 
 
281 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  28.99 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  31.07 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  35.2 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  32.05 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  29.18 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  30.65 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  35.75 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  30.86 
 
 
280 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  30.86 
 
 
280 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  51.95 
 
 
245 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  32.67 
 
 
230 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  52.83 
 
 
228 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  29.13 
 
 
257 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  47.73 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  27.64 
 
 
206 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  47.73 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  45.45 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  27.11 
 
 
285 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  48.84 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  27.02 
 
 
233 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  28.57 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  26.67 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  26.24 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  25.54 
 
 
250 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  25.79 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  23.68 
 
 
267 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  27.17 
 
 
224 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  26.88 
 
 
223 aa  45.8  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  27.2 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  33.07 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  26.78 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  26.67 
 
 
223 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>