44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1808 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  100 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  90.31 
 
 		 286 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  71.88 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  44.86 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  43.1 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  33.59 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  33.22 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  35.5 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  37.35 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  34.29 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  41.8 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  42.15 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  42.15 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  45.61 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  45.45 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  39.17 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  53.97 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  59.65 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  59.65 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  59.65 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  59.65 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  59.65 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  59.65 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  59.65 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  33.2 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  29.36 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  48.57 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  25.65 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  29.83 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  29.46 
 
 		 223 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  55 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  34.09 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  52.38 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  30.33 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  45.45 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  50 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  30.56 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  30.56 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  27.23 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  42.86 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  25.45 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  26.09 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  24.53 
 
 		 205 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  25.59 
 
 		 233 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>