41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1978 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  74.31 
 
 		 288 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  74.83 
 
 		 286 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  43.73 
 
 		 245 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  45 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  35.1 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  39.29 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  35.82 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  37.13 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  33.44 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  44.34 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  43.59 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  44.34 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  44.34 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  43.93 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  61.54 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  49.4 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  28.76 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  31 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  40 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  31.2 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  46.38 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  46.38 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  46.38 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  46.38 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  46.38 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  46.38 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  46.38 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  31.56 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  30.24 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  35.34 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  30.24 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  48.89 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  55 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  46.67 
 
 		 290 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  45.45 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  51.22 
 
 		 332 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  28.44 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  27.75 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  24.75 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.12 
 
 		 194 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>