93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1686 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  450  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  38.71 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  32.27 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  38.58 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  38.08 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  29.03 
 
 		 215 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  50 
 
 		 313 aa  85.1  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  34.27 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  52.56 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  51.28 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  51.85 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  32.52 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  48.61 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  33.98 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  27.94 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  28.92 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  27.35 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  60 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  60 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  60 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  29.6 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  29.95 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  52 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  50 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  28.35 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  42.25 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 		 533 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  29.66 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  31.36 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  37.04 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  38.67 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  57.5 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  29.24 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  37.18 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  37.18 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  55 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  34.69 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  31.91 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  44.78 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  27.2 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  33.67 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  33.67 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  33.67 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  33.67 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  33.67 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  33.67 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  33.67 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  31.17 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  21.91 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  30.88 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  38.03 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  31.71 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  30.77 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  30.49 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3328  sporulation domain-containing protein  29.55 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  26.95 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  36.47 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  25.81 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  30.88 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  30.89 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  30.56 
 
 		 280 aa  45.4  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  31.51 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  35.53 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  35.06 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  25.77 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1943  sporulation related protein  42.11 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.932522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  25.81 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  36.36 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  28.95 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  38.36 
 
 		 345 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  28.95 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  40 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  32.91 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  29.58 
 
 		 709 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  25.4 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  25.4 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  30.14 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  30.23 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  23.46 
 
 		 203 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  36.62 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  40.54 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  33.8 
 
 		 210 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  25.27 
 
 		 240 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  25.27 
 
 		 240 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  31.34 
 
 		 303 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>