More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1548 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  67.51 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.78 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  49 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  42.29 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  42.02 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  42.74 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  43.38 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  41.41 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  42.72 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  33.1 
 
 		 281 aa  164  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  44.08 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  50 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  44.65 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  44.65 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  44.65 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  37.83 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  43.4 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  40.29 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  39.32 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  38.89 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  40.29 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  40.91 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  41.83 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  38.04 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  39.77 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  38.71 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  34.93 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  34.93 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  34.19 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  34.93 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  43.14 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  38.26 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  36.84 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  34.19 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  38.97 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  37.7 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  43.08 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  44.97 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  44.51 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.27 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  43 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  37.7 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  46.03 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  37.3 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  59.13 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  36.15 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  45.5 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  41.28 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  42.56 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  58.26 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  31.9 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  36.21 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  34.84 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  37 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  57.39 
 
 		 342 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  57.39 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  47.1 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  55.65 
 
 		 314 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  38.22 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  37.04 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  38.46 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  42.47 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  39.07 
 
 		 297 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  41.36 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  36.89 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  37.97 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  55.65 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  55.37 
 
 		 321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  32.43 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  34.68 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  34.41 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  57.26 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  55.75 
 
 		 367 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  41.85 
 
 		 394 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  54.7 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  36.24 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  54.33 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  56.41 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 314 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  41.01 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  50 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  41.8 
 
 		 474 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 455 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  48.46 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  40.56 
 
 		 442 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  53.51 
 
 		 468 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  41.62 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  51.97 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 382 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  44.38 
 
 		 318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  47.26 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  39.77 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  43.97 
 
 		 409 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  64.52 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  50.82 
 
 		 186 aa  125  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  51.3 
 
 		 415 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>