More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3795 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  100 
 
 		 337 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  72.59 
 
 		 341 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  73.39 
 
 		 342 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  65.89 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  65.31 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  69.52 
 
 		 335 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  73.1 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  64.6 
 
 		 332 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  65.27 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  65.27 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  64.58 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  41.22 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  41.32 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  42.12 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  40.88 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  42.18 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  38.19 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  38.33 
 
 		 265 aa  183  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  38.33 
 
 		 261 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  39.3 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  36.67 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.31 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  39.3 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  53.11 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  38.14 
 
 		 310 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  50 
 
 		 265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  39.11 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  57.75 
 
 		 265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  38.37 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  45.41 
 
 		 415 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 264 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  45 
 
 		 417 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  37.92 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  57.04 
 
 		 260 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  40.07 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  45.74 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  45.5 
 
 		 277 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  45.5 
 
 		 277 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  34.94 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  44.97 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.31 
 
 		 267 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 270 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  44.85 
 
 		 281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  34.98 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  46.52 
 
 		 455 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  54.89 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  53.9 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 474 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  54.89 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  54.89 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  47.31 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  36.04 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  58.12 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  48.24 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 408 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  41 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  60.98 
 
 		 419 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  60.98 
 
 		 421 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  32.04 
 
 		 284 aa  149  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  41.6 
 
 		 273 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  51.85 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  39.83 
 
 		 273 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  43.4 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  53.44 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  35.77 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  64.55 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  38.26 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.44 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  60.71 
 
 		 259 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  56.78 
 
 		 243 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  36.62 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  52.34 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  43.62 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  49.64 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  60 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.93 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  56.1 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  55.65 
 
 		 259 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  49.63 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  58.72 
 
 		 260 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  32.52 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  41.23 
 
 		 471 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  47.4 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  42.25 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  49.26 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  47.4 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  56.36 
 
 		 442 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  44.2 
 
 		 281 aa  137  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50.79 
 
 		 211 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  34.32 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50.79 
 
 		 230 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  48.15 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  57.28 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>