More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4362 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  97.66 
 
 		 342 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  100 
 
 		 342 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  79.94 
 
 		 335 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  72.73 
 
 		 333 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  71.39 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  71.85 
 
 		 333 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  71.55 
 
 		 333 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  66.09 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  64.53 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  64.62 
 
 		 337 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  65.41 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  44.41 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  38.78 
 
 		 297 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  41.73 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  36.95 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  41.32 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  37.09 
 
 		 278 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  39.39 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  36.42 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  38.62 
 
 		 324 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.51 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  42.37 
 
 		 285 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  36.65 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  36.65 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  35.85 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  38.67 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  50.79 
 
 		 264 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  52.15 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 281 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  39.76 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  47.34 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  56.74 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  58.65 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  56.74 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  56.03 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  58.45 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 297 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  32.25 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  37.68 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  33.72 
 
 		 423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  37.3 
 
 		 286 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  32.06 
 
 		 417 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 455 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53.9 
 
 		 269 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  43.08 
 
 		 474 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  43.72 
 
 		 468 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.12 
 
 		 267 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  53.9 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  33.99 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  46.07 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  39.83 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  35.95 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  38.43 
 
 		 286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  34.75 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  57.36 
 
 		 258 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  36.15 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  58.12 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  36.36 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  38.35 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  42.78 
 
 		 442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  55.65 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  58.26 
 
 		 259 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  35.27 
 
 		 331 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  48.5 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  59.29 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  59.83 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  56.3 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  36.53 
 
 		 284 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  52.45 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  49.63 
 
 		 409 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  51.75 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  51.45 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  40.21 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  59.82 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  59.82 
 
 		 421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  41.88 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  60.91 
 
 		 424 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  51.06 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  34.29 
 
 		 260 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  39.39 
 
 		 211 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  39.53 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.24 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52.1 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  45.4 
 
 		 283 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  36.44 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  40.7 
 
 		 230 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  55.36 
 
 		 254 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  48.25 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  39.39 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  48.95 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>