15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0924 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0924  sporulation domain protein  100 
 
 		 268 aa  524  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3589  sporulation related  51.81 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1279  putative lipoprotein  49.29 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288589  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2200  sporulation domain-containing protein  44.1 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0549  hypothetical protein  43.67 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1238  sporulation domain-containing protein  39.45 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.192754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  33.67 
 
 		 213 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  24.72 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  25.83 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  32.31 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  44.9 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  34.62 
 
 		 194 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  38.98 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>