36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0295 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  559  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  49.46 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1945  hypothetical protein  48.56 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.749075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  23.88 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  23.88 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  25.34 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  22.85 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  31.17 
 
 		 186 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  24.07 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  31.58 
 
 		 232 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  30.23 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  30.23 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  28.95 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  33.8 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  30.26 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  32.47 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  31.4 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  30.26 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  23.25 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  27.63 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  28.95 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  32.47 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  26.03 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  26.03 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  26.03 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  30.26 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 		 199 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  30.14 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  31.51 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  22.83 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  23.97 
 
 		 198 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  27.63 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  25.33 
 
 		 213 aa  42  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>