32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1136 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1136  Sporulation domain protein  100 
 
 
244 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1018  sporulation domain-containing protein  40.71 
 
 
273 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0660774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2303  sporulation domain-containing protein  30.14 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00342773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  28.83 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  38.01 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  52.11 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1435  sporulation-related protein  29.69 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.419741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3376  Sporulation domain protein  46.55 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2531  sporulation related protein  29.23 
 
 
199 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.275195  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  45.31 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  36.36 
 
 
346 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  39.19 
 
 
177 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  30.54 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  31.03 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  28.08 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  29.52 
 
 
186 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  33.85 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3214  sporulation domain-containing protein  30.94 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  30.68 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  33.87 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  37.1 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  32.56 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  36.17 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  35.11 
 
 
471 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  33 
 
 
978 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  29.82 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  36.17 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  30.3 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  30 
 
 
328 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  30 
 
 
328 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>