46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0878 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  100 
 
 		 978 aa  1970    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  56.17 
 
 		 993 aa  948    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  97.88 
 
 		 990 aa  1859    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  37.44 
 
 		 1079 aa  214  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  36.07 
 
 		 1108 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  39.44 
 
 		 727 aa  194  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  40.8 
 
 		 911 aa  183  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.25 
 
 		 835 aa  122  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  29.72 
 
 		 474 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  31.82 
 
 		 463 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  29.36 
 
 		 511 aa  105  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  31.64 
 
 		 458 aa  104  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  28.77 
 
 		 472 aa  98.6  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  28.45 
 
 		 472 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  30.26 
 
 		 480 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  32.08 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  29.97 
 
 		 481 aa  80.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  43.36 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  43.3 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  26.28 
 
 		 281 aa  76.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  39.66 
 
 		 529 aa  68.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  37.21 
 
 		 276 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  31.72 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  30.4 
 
 		 277 aa  63.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  30.53 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 340 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 318 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 340 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 340 aa  52  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 328 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  32.05 
 
 		 321 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  29.08 
 
 		 307 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 328 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 330 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  31.25 
 
 		 242 aa  49.7  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  28.01 
 
 		 389 aa  48.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 291 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 313 aa  47.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  27.85 
 
 		 299 aa  47  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  27.5 
 
 		 347 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  30.38 
 
 		 467 aa  45.4  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 341 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  29.11 
 
 		 378 aa  45.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>