More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1651 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 299 aa  604  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  83.52 
 
 		 262 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  50.5 
 
 		 286 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  44.14 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  46.74 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  42.36 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  43.62 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 380 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  43.99 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  42.91 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  45.85 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  43.45 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  45.06 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  45.8 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  41.79 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  41.6 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  40.64 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  40.64 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  41.2 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  59.2 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  59.2 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  51.09 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  54.48 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 239 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  49.62 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  53.19 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  58.27 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  46.96 
 
 		 215 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  34.92 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  47.27 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.79 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  42.62 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 618 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.66 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  38.17 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  43.81 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  43.93 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  40.48 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.12 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  43.52 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.19 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.02 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  45.28 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  40.31 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  34.71 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  40.5 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.84 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  43.52 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  33.83 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 		 1160 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  41.44 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 189 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  39.34 
 
 		 204 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  36.36 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  36.96 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  42.24 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  42.2 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  37.29 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  35.54 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  35.54 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  35.54 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.25 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  41.35 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  35.54 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  35.54 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  35.54 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0798  lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.44501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  35.54 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  40.71 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  42.37 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  35.54 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  35.42 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  35.54 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  38.41 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.33 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>