More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5561 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 340 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  91.76 
 
 		 340 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  70.97 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  59.33 
 
 		 363 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  59.56 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  59.25 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  59.56 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  59.63 
 
 		 363 aa  328  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  59.44 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  54.87 
 
 		 291 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  53.57 
 
 		 291 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  47.71 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  40.13 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  41.42 
 
 		 380 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  39.35 
 
 		 343 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  39.2 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  38.51 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  56.67 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  37.54 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  52.87 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  59.84 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  33.44 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  60.16 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  55.2 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  44.1 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  45.33 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 260 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.98 
 
 		 260 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.62 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.08 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  38.19 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  43.97 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  37.19 
 
 		 1160 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40.68 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  39.37 
 
 		 242 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  41.96 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  39.53 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  38.84 
 
 		 140 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.1 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  38.57 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  42.06 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  40.15 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  43.36 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  44.68 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  42.74 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  41.74 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.19 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.02 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  45.36 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  35.04 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  37.5 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.71 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 		 716 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  43.93 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  35.04 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  37.69 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  35.04 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  35.04 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2287  phage internal core protein  36.67 
 
 		 1569 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  40.46 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  42.74 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  34.19 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  43.33 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 199 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  35.22 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  33.68 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  35.43 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>