More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1423 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 380 aa  779    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  82.97 
 
 		 313 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  72.01 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  71.48 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  65.05 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  65.67 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  65.45 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  47.2 
 
 		 291 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  47.52 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  46.13 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  42.07 
 
 		 340 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  45.42 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  44.67 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  44.87 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  44.61 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  43.89 
 
 		 328 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  39.72 
 
 		 286 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  58.33 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  58.33 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  57.46 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  55.24 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  59.12 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  39.33 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  55.47 
 
 		 239 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  55.47 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  53.68 
 
 		 262 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  52.05 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  49.65 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  44.8 
 
 		 202 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  37.9 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  39.68 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  34.18 
 
 		 1160 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  38.89 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  40.8 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  40.16 
 
 		 204 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 		 204 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  37.1 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 204 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.84 
 
 		 291 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  38.81 
 
 		 218 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.31 
 
 		 235 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  41.6 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.68 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.06 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  32.07 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  41.53 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  39.37 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  34.67 
 
 		 189 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  38.21 
 
 		 242 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 228 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  43.43 
 
 		 211 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  41.9 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.67 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 		 716 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.01 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  34.9 
 
 		 268 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  31.55 
 
 		 191 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.53 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  41.96 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  41.49 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  42.06 
 
 		 199 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  32.31 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  37.31 
 
 		 238 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  35.88 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  34.68 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  38.52 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  40.34 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  37.61 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  38.17 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  33.75 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  35.97 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  40.78 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  40.34 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.59 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>