More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1603 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  52.97 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  63.78 
 
 		 258 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  62.56 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  55.46 
 
 		 310 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  54.31 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  59.47 
 
 		 257 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  50.83 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  52.56 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  51.71 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  53.36 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  56.08 
 
 		 197 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  54.46 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  57.75 
 
 		 268 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  53.69 
 
 		 254 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  50.68 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  63.46 
 
 		 300 aa  184  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  51.69 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  60.34 
 
 		 272 aa  181  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  51.94 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  50.52 
 
 		 338 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  48.44 
 
 		 254 aa  178  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  50.9 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  58.64 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  64.33 
 
 		 251 aa  174  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  45.26 
 
 		 336 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  56.05 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  50.51 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  55.42 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  55.42 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  60.26 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  54.04 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  49.43 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  55.3 
 
 		 439 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  59.52 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  54.14 
 
 		 460 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  51.63 
 
 		 484 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  49.11 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  61.74 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  56.1 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  43.59 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.75 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  47.54 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  44.92 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  41.53 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  42.34 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  43.65 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  46.28 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.86 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  37.68 
 
 		 663 aa  81.3  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.98 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  44.26 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  42.06 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  40.65 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  46.49 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  42.42 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  41.67 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 329 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  43.08 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  43.08 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  44.07 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  41.67 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  43.97 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2967  Lytic transglycosylase catalytic  43.07 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.335517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  41.8 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  40.5 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  42.19 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.68 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  39.84 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  42.06 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  44.07 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  42.74 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  39.23 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  41.53 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  42.62 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>