More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1820 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  57.69 
 
 		 439 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  55.1 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  59.52 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  58.27 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  58.21 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  52.78 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  57.81 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  60.8 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  54.33 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  50.35 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  61.29 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  46.41 
 
 		 460 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  49.69 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  55.47 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  45.77 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  50.36 
 
 		 197 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  55.47 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  58.54 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  50.35 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  58.54 
 
 		 272 aa  131  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  53.49 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  56.8 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  50.79 
 
 		 484 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  58.12 
 
 		 217 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  55.91 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  55.12 
 
 		 268 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  56 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  57.6 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  40.28 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  48.57 
 
 		 223 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  53.12 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  53.12 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  55.91 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  48.78 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  56.69 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  51.18 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  58.06 
 
 		 120 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  44.27 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  41.22 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.57 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  41.35 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.78 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  42.19 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  42.19 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  38.52 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.68 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  42.15 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.68 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  36.88 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  47.57 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.29 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  38.4 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 716 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.65 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  40.98 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.55 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  35.86 
 
 		 189 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  39.37 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  39.46 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  41.53 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  36.87 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  38.81 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  41.75 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  42.62 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  38.17 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  41.8 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  36.23 
 
 		 217 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  36.29 
 
 		 593 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  36.29 
 
 		 593 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 661 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  37.72 
 
 		 204 aa  62  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  37.8 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.92 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  41.58 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  37.8 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  34.35 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>