More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0181 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  49.36 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  48.13 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  49.1 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  46.99 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  49.68 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  46.63 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  47.73 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  47.28 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  44.97 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  47.93 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  43.89 
 
 		 338 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  47.4 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  45.41 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  41.52 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  43.01 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  45.68 
 
 		 276 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  48.05 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 262 aa  121  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  45.62 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  44.2 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  44.3 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  51.02 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  48.52 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  49.62 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  44.03 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  43.56 
 
 		 259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  43.56 
 
 		 259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  55.17 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  52.17 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  45.57 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  45.11 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  54.65 
 
 		 120 aa  95.9  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  39.67 
 
 		 439 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  36.75 
 
 		 484 aa  92  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 460 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  48.72 
 
 		 199 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  45.83 
 
 		 202 aa  85.5  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  47.11 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  45.69 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  45.69 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  38.13 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41.67 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  48.04 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  44.26 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  46.08 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  41.13 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.66 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  38.92 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  40.17 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  49.06 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  43.69 
 
 		 175 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  42.5 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  42.5 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  45.05 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  39.85 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  37.02 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  44.54 
 
 		 291 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 321 aa  72  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  48.57 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.24 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  38.32 
 
 		 340 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  44.76 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  42.71 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  44.74 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  38.21 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  36.99 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  37.67 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  45.1 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  35.77 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>