More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7436 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  57.79 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  57.51 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  55.05 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  51.47 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  57.07 
 
 		 257 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.31 
 
 		 257 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  53.57 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  51.34 
 
 		 301 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  55.32 
 
 		 253 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  54.26 
 
 		 276 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  49.26 
 
 		 268 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  51.06 
 
 		 233 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  61.64 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  52.55 
 
 		 242 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  52.38 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  60.96 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  52.04 
 
 		 265 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  53.69 
 
 		 300 aa  180  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  60.96 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  56.04 
 
 		 217 aa  177  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  53.09 
 
 		 251 aa  175  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  50.26 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  58.62 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  49.26 
 
 		 336 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  48.02 
 
 		 259 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  48.02 
 
 		 259 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  53.79 
 
 		 338 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  57.14 
 
 		 240 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  52.53 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  48.17 
 
 		 276 aa  154  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  46.83 
 
 		 262 aa  145  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  53.08 
 
 		 439 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  60 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 460 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  47.66 
 
 		 484 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  52.03 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  44.3 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  62.5 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  43.33 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.04 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  36.22 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  43.7 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.17 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  42.02 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  41.03 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  45.28 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.83 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 247 aa  72  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  37.61 
 
 		 146 aa  72  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.79 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  37.82 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  41.74 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  39.83 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  40 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  38.98 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  39.32 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.45 
 
 		 716 aa  67.4  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.5 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  40.28 
 
 		 661 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  38.98 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>