More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0633 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 439 aa  867    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  57.95 
 
 		 460 aa  203  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  43.5 
 
 		 301 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  50.77 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  53.66 
 
 		 210 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  54.79 
 
 		 254 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  57.69 
 
 		 251 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  58.65 
 
 		 258 aa  156  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  55.22 
 
 		 310 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  56.83 
 
 		 238 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 257 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  54.11 
 
 		 253 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  50.38 
 
 		 276 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  56.92 
 
 		 338 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  51.11 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  54.48 
 
 		 242 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  53.85 
 
 		 233 aa  146  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  54.62 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  48.26 
 
 		 238 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 		 254 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  54.69 
 
 		 257 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  53.08 
 
 		 197 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  54.41 
 
 		 251 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  52.45 
 
 		 268 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  56.06 
 
 		 233 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 265 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 231 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  53.68 
 
 		 259 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  53.68 
 
 		 259 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  53.54 
 
 		 223 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  40.17 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 		 276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  51.85 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  56.41 
 
 		 217 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  47.83 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  51.13 
 
 		 240 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  47.14 
 
 		 261 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  45.93 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  47.76 
 
 		 242 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  51.61 
 
 		 120 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 		 234 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42.4 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  38.35 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  43.64 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  43.2 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 258 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41.86 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.48 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  29.28 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  44.86 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.14 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.45 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  34.06 
 
 		 234 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 280 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  33.11 
 
 		 202 aa  67  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  35.26 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  36.17 
 
 		 593 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.97 
 
 		 206 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 209 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  39.29 
 
 		 174 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  39.37 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  36.76 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  42.73 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  34.09 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2967  Lytic transglycosylase catalytic  37.59 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.335517  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 673 aa  63.5  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.93 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.57 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 642 aa  63.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  42.45 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  30.39 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 716 aa  63.2  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  36.03 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 198 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  36.03 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  33.07 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  35.04 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  35.34 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.03 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  39.62 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  37.12 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  38.53 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.18 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  40.57 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  38.68 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>