More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2016 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  53.66 
 
 		 439 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  48.3 
 
 		 460 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  46.89 
 
 		 257 aa  134  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  55.28 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  51.61 
 
 		 484 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  51.8 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  51.97 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  52.07 
 
 		 301 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  57.14 
 
 		 338 aa  131  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  54.03 
 
 		 265 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  52.94 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  48.63 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  45.73 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  48.97 
 
 		 336 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  53.66 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.03 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  39.7 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  44.69 
 
 		 272 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  50.38 
 
 		 231 aa  121  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 		 259 aa  121  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 		 259 aa  121  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  42.4 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  44.26 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  52.03 
 
 		 254 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  54.47 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  48.91 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 276 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  54.31 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  50.81 
 
 		 300 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  51.22 
 
 		 261 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  50.82 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  52.42 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  45.11 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  39.9 
 
 		 262 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  42.24 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.62 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  40.41 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  39.61 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  40.28 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  41.72 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  38.41 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.8 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  37.5 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  37.87 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.48 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  39.34 
 
 		 326 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  37.58 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  38.22 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  31.74 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.52 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.84 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  39.37 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  39.64 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  38.58 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  37.31 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.93 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  41.41 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  30.43 
 
 		 663 aa  62.4  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.95 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  37.86 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  38.58 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  35.25 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  38.58 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  38.58 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  38.57 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  36.31 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  39.17 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>