More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2251 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 
254 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  59.44 
 
 
257 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  44.05 
 
 
310 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  42.42 
 
 
301 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  50 
 
 
276 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  52.49 
 
 
258 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  55.64 
 
 
233 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  59.54 
 
 
241 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  48.17 
 
 
197 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 
336 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  59.35 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  47.02 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  47.42 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  51.81 
 
 
242 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  52.26 
 
 
238 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  45.98 
 
 
261 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  50.7 
 
 
460 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  49.66 
 
 
254 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  47.9 
 
 
242 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 
254 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  46.73 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  51.57 
 
 
272 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  47.93 
 
 
268 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  51.66 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  47.65 
 
 
338 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  52.21 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  45.79 
 
 
238 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  54.4 
 
 
233 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 
439 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  53.28 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  46.24 
 
 
240 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  53.28 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  51.57 
 
 
217 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 
223 aa  132  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  56 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  50.35 
 
 
251 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  48.09 
 
 
484 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  45.68 
 
 
234 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 
210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  48.76 
 
 
120 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  52.17 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  42.52 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.07 
 
 
199 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  37.78 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  39.68 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  42.22 
 
 
660 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41.67 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  44.07 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 
673 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  42.62 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  41.88 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  37.58 
 
 
340 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
209 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
209 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 
643 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  42.5 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  46.46 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  39.84 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  40.31 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
682 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  37.87 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  39.34 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  39.34 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  49.48 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  40.6 
 
 
650 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  41.35 
 
 
642 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  42.71 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.31 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 
642 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  41.54 
 
 
654 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  34.41 
 
 
650 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  41.59 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  37.3 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40.16 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  41.35 
 
 
642 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  39.85 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  40.6 
 
 
657 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  40.6 
 
 
657 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.8 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  38.57 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.55 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.98 
 
 
188 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>