More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3004 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 278 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  66.81 
 
 		 239 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  52.87 
 
 		 341 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  60.74 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  59.4 
 
 		 347 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  48.92 
 
 		 380 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  60.9 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  58.52 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  61.48 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  57.14 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  63.41 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  60.66 
 
 		 340 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  61.48 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  59.84 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  60.66 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  61.16 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  59.84 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  58.21 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  58.2 
 
 		 363 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  58.2 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  53.71 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  65.29 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  56.25 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  60.98 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  51.18 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  51.22 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  49.63 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  50.75 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  54.17 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  46.03 
 
 		 303 aa  99  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  49.21 
 
 		 328 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 1160 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.62 
 
 		 368 aa  86.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  46.96 
 
 		 202 aa  85.5  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.43 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  43.18 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  44.63 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  46.02 
 
 		 197 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  40.5 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.12 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  46.02 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  46.02 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  32.39 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  38.4 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  41.6 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  40.35 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  36.15 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  35.26 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  36.88 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  42.5 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  40.32 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  41.38 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  35.26 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  35.53 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  42.24 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  37.9 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.71 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  38.73 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.4 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  41.74 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  45.61 
 
 		 189 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  39.1 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  44.25 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  39.2 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  39.01 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.19 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  40.87 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  42.61 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  37.12 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  39.52 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.68 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  45.95 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>