More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1642 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
318 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  86.79 
 
 
318 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  56.68 
 
 
328 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 
303 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  44.87 
 
 
380 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  44.11 
 
 
343 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  43.89 
 
 
347 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  42.26 
 
 
330 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  43.8 
 
 
291 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  41.22 
 
 
341 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  41.44 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  42.25 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  41.03 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  38.25 
 
 
328 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 
307 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 
328 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  39.93 
 
 
286 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
318 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  40.64 
 
 
299 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  51.52 
 
 
340 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  47.2 
 
 
363 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
363 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  51.52 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 
340 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 
239 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  51.22 
 
 
278 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  44.32 
 
 
262 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  51.61 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  44.88 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  45.28 
 
 
204 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  45.28 
 
 
204 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  44.55 
 
 
215 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  48.94 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  48.94 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  38.4 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  42.48 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  46.23 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  37.69 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  41.59 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  38.21 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  38.46 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50.68 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.67 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 
1160 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  39.64 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  40.18 
 
 
203 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 
206 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  41 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  34.85 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 
218 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 
154 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.19 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  41.44 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  39.64 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  43.01 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  39.67 
 
 
523 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.21 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  30.61 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  39.64 
 
 
218 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.13 
 
 
239 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
155 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
244 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 
212 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  35.45 
 
 
241 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 
208 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 
251 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 
242 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  38.33 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 
242 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
239 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  38.74 
 
 
188 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 
249 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 
158 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
239 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
239 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 
260 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>