More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1459 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 318 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  86.79 
 
 		 318 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  61.31 
 
 		 328 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  44.27 
 
 		 303 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  44.61 
 
 		 380 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  45.25 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  42.47 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  41.64 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  43.85 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  42.8 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  42.32 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  43.85 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  42.21 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  38.77 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  41.06 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  38.43 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 		 286 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  40.64 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  52.52 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  52.52 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  53.03 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  47.71 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  51.13 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  51.08 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  47.1 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  51.18 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  43.72 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  50.81 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  46.36 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  40.65 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  35.6 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  40.98 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  50 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  46.85 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  39.02 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  39.17 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.64 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 235 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  39.83 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.33 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.5 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.39 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 1160 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  41.53 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  44.68 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  37.07 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.82 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  41.07 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  35.82 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.15 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  35.21 
 
 		 798 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  39.82 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  34.56 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  35.77 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  44.44 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  34.45 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  36.72 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  46.81 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  33.11 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 		 524 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  31.97 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.74 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  34.18 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  39.67 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  46.08 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 		 155 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  38.33 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>