More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1364 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  43.2 
 
 		 325 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  42.19 
 
 		 368 aa  87.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  41.6 
 
 		 291 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  39.67 
 
 		 340 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 307 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 		 340 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  38.4 
 
 		 359 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 347 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 		 291 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 		 340 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  38.4 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 380 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 341 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 291 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 327 aa  74.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 363 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 246 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 370 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  37.6 
 
 		 321 aa  70.5  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  36.3 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  35.25 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  37.98 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  35.25 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  36.51 
 
 		 261 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  37.3 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  42.15 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  37.3 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  37.3 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  36.51 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 258 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  34.4 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  37.19 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  32.81 
 
 		 484 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 258 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  35.43 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  30.83 
 
 		 242 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  38.05 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 		 251 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 272 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 207 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  32.28 
 
 		 204 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  35.38 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  37.72 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  31.88 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  32.79 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  35.54 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.75 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  35.71 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  35.71 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  35.71 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  31.39 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  35.71 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 		 318 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  31.5 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 299 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.36 
 
 		 448 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 281 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  31.5 
 
 		 254 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  29.29 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 		 669 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  39.29 
 
 		 522 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  34.13 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  31.11 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  33.86 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  31.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  33.57 
 
 		 495 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 460 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  31.78 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  31.71 
 
 		 438 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>