More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4762 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  65.76 
 
 		 380 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  71.48 
 
 		 313 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  64.42 
 
 		 330 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  69.36 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  69.44 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  64.95 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  50.95 
 
 		 291 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  49.62 
 
 		 291 aa  235  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  46.21 
 
 		 307 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  44.88 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  44.55 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  39.94 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  44.77 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  41.42 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  43.87 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  40.45 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  41.98 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  42.59 
 
 		 299 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  40.96 
 
 		 318 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  40.67 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 328 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  59.71 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  57.45 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  38.06 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  49.07 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  52.32 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  55.04 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  28.34 
 
 		 1160 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  38.4 
 
 		 140 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  38.85 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.79 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  39.17 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 		 233 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  37.72 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 716 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.9 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.32 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  34.27 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  38.33 
 
 		 204 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  32.53 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  40.18 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  42.35 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  32.29 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  32.06 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.58 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  37.32 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  38.52 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.92 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  38.52 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  40.57 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 211 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  39.37 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  38.02 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  46.91 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  32.64 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  38.84 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  36.84 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  31.28 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  38.84 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  38.52 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  38.24 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  33.58 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  36.75 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  34.92 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 200 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  32.19 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 195 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  31.36 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.68 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  38.4 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>