More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4537 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 
448 aa  874    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  52.94 
 
 
291 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  46.71 
 
 
280 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 
191 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  56.9 
 
 
318 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  45.89 
 
 
199 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  47.86 
 
 
174 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  44 
 
 
189 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  34.73 
 
 
215 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  47.69 
 
 
243 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  49.19 
 
 
212 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  48.33 
 
 
204 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  52.59 
 
 
271 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  49.56 
 
 
228 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  47.75 
 
 
202 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  48.28 
 
 
438 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  53.1 
 
 
217 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  51.79 
 
 
245 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 
283 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  49.56 
 
 
206 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  51.3 
 
 
368 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  48.21 
 
 
235 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  55.66 
 
 
258 aa  106  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 
204 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 
200 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  48.76 
 
 
237 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50 
 
 
370 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  45.74 
 
 
329 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  47.54 
 
 
328 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  49.11 
 
 
199 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 
211 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  41.21 
 
 
218 aa  103  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  44.86 
 
 
242 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.24 
 
 
239 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  49.17 
 
 
278 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.02 
 
 
247 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.45 
 
 
217 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  50.42 
 
 
325 aa  100  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 
245 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 
297 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  45 
 
 
297 aa  99.8  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  48.21 
 
 
362 aa  99.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  46.49 
 
 
196 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.3 
 
 
207 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  42.64 
 
 
299 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  45.69 
 
 
260 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  46.49 
 
 
260 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  52.99 
 
 
291 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  45.31 
 
 
206 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
244 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  44.63 
 
 
326 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 
218 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44.72 
 
 
249 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  44.72 
 
 
204 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
251 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
251 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
251 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  51.18 
 
 
321 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  43.44 
 
 
239 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  43.44 
 
 
239 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  43.44 
 
 
239 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 
261 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 
261 aa  97.1  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  46.61 
 
 
188 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 
261 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 
261 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  46.49 
 
 
251 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
291 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  46.61 
 
 
327 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 
261 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.8 
 
 
226 aa  96.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  46.02 
 
 
195 aa  96.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  42.15 
 
 
202 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.83 
 
 
214 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 
217 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  32.72 
 
 
238 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 
197 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  37.5 
 
 
261 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  47.57 
 
 
261 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 
261 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 
203 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  46.43 
 
 
362 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  37.5 
 
 
261 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  37.5 
 
 
261 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  37.5 
 
 
259 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  46.28 
 
 
218 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 
263 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  42.03 
 
 
194 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
198 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  43.65 
 
 
208 aa  93.6  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  44.9 
 
 
329 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  40.82 
 
 
197 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  43.94 
 
 
224 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  44.64 
 
 
196 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  43.18 
 
 
215 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  43.97 
 
 
304 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  47.01 
 
 
202 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  42.03 
 
 
218 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  42.96 
 
 
198 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  48.78 
 
 
307 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.725987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>