More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0798 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0798  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
351 aa  694    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.44501  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  48.25 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  45.7 
 
 
618 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  49.67 
 
 
733 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 
547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  45.14 
 
 
523 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  45.03 
 
 
544 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 
498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  45.52 
 
 
620 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  39.73 
 
 
448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  44.37 
 
 
495 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  42.07 
 
 
617 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  40.26 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  45.71 
 
 
556 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  42.03 
 
 
440 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  37.89 
 
 
587 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 
595 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  40.85 
 
 
415 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  42.48 
 
 
451 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  41.01 
 
 
638 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  41.25 
 
 
281 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1137  Lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 
304 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 
555 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40.43 
 
 
372 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  43.7 
 
 
650 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 
570 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40.43 
 
 
372 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 
379 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.72 
 
 
372 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
522 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 
561 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 
596 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  38.3 
 
 
514 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  38.17 
 
 
504 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 
504 aa  99.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 
610 aa  99.4  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  41.84 
 
 
578 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  38.62 
 
 
516 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
515 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40.43 
 
 
547 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  38.06 
 
 
516 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  35.58 
 
 
661 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.31 
 
 
538 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1814  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
276 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  38.76 
 
 
451 aa  95.9  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  37.66 
 
 
451 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 
499 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  38.04 
 
 
544 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1461  lytic transglycosylase, catalytic  39.26 
 
 
509 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0063107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  39.01 
 
 
498 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 
524 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  37.24 
 
 
507 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0499  Lytic transglycosylase catalytic  35.33 
 
 
279 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 
467 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  37.65 
 
 
506 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2292  Lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40.56 
 
 
531 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 
511 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  40.56 
 
 
528 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  39.86 
 
 
524 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  35.97 
 
 
383 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  40.56 
 
 
529 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  37.24 
 
 
693 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  40.56 
 
 
529 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.86 
 
 
530 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.86 
 
 
530 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  39.86 
 
 
530 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1320  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  37.58 
 
 
512 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367153  normal  0.0421613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.86 
 
 
530 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  39.86 
 
 
552 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.86 
 
 
553 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.86 
 
 
530 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  40.56 
 
 
525 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  39.16 
 
 
564 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  40.56 
 
 
525 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  40.56 
 
 
525 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  36.96 
 
 
523 aa  90.1  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  33 
 
 
499 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 
564 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  40.38 
 
 
562 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 
561 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  36.02 
 
 
484 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000744  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.19 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1021  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 
477 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.847474  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  33.33 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  40.14 
 
 
572 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  37.14 
 
 
518 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 
498 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  36.02 
 
 
487 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  40.14 
 
 
573 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  43.2 
 
 
426 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  43.2 
 
 
1001 aa  87  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  43.2 
 
 
1021 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  38.57 
 
 
570 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  40.56 
 
 
573 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.13 
 
 
530 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  38.57 
 
 
557 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 
1079 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  40.69 
 
 
534 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>