28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1733 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  748    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  28.97 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  36 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  32.5 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  36.73 
 
 		 533 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  26.88 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  28.75 
 
 		 535 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  27.55 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 		 993 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  37.66 
 
 		 356 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  27.5 
 
 		 505 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  34.67 
 
 		 911 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 		 277 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 		 966 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  33.08 
 
 		 474 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  33.67 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  26.83 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  29.11 
 
 		 990 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  37.33 
 
 		 472 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  29.11 
 
 		 978 aa  46.6  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  29.63 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  34.29 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  31.58 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  30 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  27.42 
 
 		 529 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  28.4 
 
 		 1079 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>