40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1806 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  100 
 
 
470 aa  939    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  73.58 
 
 
481 aa  622  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  48.23 
 
 
480 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  41.2 
 
 
545 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  48.24 
 
 
535 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  43.02 
 
 
505 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  39.16 
 
 
281 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  29.22 
 
 
474 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  28.7 
 
 
990 aa  89  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  28.11 
 
 
978 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  30.29 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  29.58 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  27.45 
 
 
966 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  46.25 
 
 
334 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  39.08 
 
 
1079 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  32.01 
 
 
911 aa  75.1  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  27.38 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  43.53 
 
 
993 aa  73.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  43.9 
 
 
276 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  35.4 
 
 
533 aa  68.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  48.35 
 
 
529 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  36.14 
 
 
1108 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  31.71 
 
 
277 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  35 
 
 
356 aa  64.3  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  37.97 
 
 
727 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  32.98 
 
 
835 aa  58.9  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  35.8 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  26.78 
 
 
511 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  32.93 
 
 
468 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  32.47 
 
 
428 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  31.4 
 
 
237 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  27.55 
 
 
378 aa  50.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  31.65 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  29.35 
 
 
292 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 
321 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  32.47 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  30 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  38.16 
 
 
243 aa  43.5  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>