48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1159 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 966 aa  1885    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  42.91 
 
 		 1079 aa  325  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  43.05 
 
 		 911 aa  300  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 		 993 aa  208  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  34.29 
 
 		 727 aa  146  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  32.98 
 
 		 474 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.67 
 
 		 835 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  27.7 
 
 		 281 aa  101  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  29.02 
 
 		 472 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  29.86 
 
 		 463 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  29.32 
 
 		 472 aa  98.6  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  28.11 
 
 		 511 aa  97.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  26.7 
 
 		 468 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  28.84 
 
 		 481 aa  89.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  44.55 
 
 		 505 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  29.55 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  41.96 
 
 		 535 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  37.1 
 
 		 1108 aa  77.8  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  35.61 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  36.46 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 340 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  29.53 
 
 		 242 aa  60.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  30.21 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  32.98 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  32.98 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 340 aa  57  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 291 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  36.25 
 
 		 313 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  30.41 
 
 		 467 aa  53.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 340 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  36.25 
 
 		 330 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 347 aa  52.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 321 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 343 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 341 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  33.75 
 
 		 380 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  36.25 
 
 		 291 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  31.65 
 
 		 378 aa  48.9  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 533 aa  48.5  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  25.93 
 
 		 389 aa  48.1  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  31.25 
 
 		 359 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  26.47 
 
 		 299 aa  45.8  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>