54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2481 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 463 aa  897    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  73 
 
 		 468 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  45.6 
 
 		 474 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  45.29 
 
 		 472 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  45.58 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  31.32 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  31.27 
 
 		 990 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  31.86 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  30.97 
 
 		 978 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  63.41 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  29.86 
 
 		 966 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  32.01 
 
 		 993 aa  103  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  29.37 
 
 		 911 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  29.74 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  29.12 
 
 		 281 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  26.49 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  36.43 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  35.65 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  28.48 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  38.55 
 
 		 1079 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  41.03 
 
 		 727 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  35 
 
 		 1108 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  27.01 
 
 		 277 aa  63.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  34.26 
 
 		 535 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  35.37 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  22.16 
 
 		 835 aa  56.2  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  36.56 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  31.4 
 
 		 237 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  31.72 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  26.35 
 
 		 313 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  36.99 
 
 		 533 aa  50.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  31.76 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  29.2 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0790  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.77 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1371  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  26.79 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  27.59 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  27.5 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2420  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.91 
 
 		 586 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0202661  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  30.3 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2393  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.73 
 
 		 573 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0818028  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  27.44 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  32 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.4 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  27.03 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0614  sporulation domain-containing protein  27.2 
 
 		 282 aa  43.9  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  32.82 
 
 		 238 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>