55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2674 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  100 
 
 		 911 aa  1800    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  39.56 
 
 		 966 aa  339  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  38.73 
 
 		 1108 aa  313  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  40.6 
 
 		 1079 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  41.11 
 
 		 993 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  41.32 
 
 		 990 aa  214  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  40.77 
 
 		 978 aa  211  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  34.72 
 
 		 727 aa  156  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  31.32 
 
 		 474 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  30.62 
 
 		 511 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  35.24 
 
 		 535 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  31.01 
 
 		 472 aa  111  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  30.34 
 
 		 472 aa  108  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  26.68 
 
 		 468 aa  105  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.46 
 
 		 835 aa  105  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  30.65 
 
 		 463 aa  104  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  29.3 
 
 		 481 aa  97.8  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  29.11 
 
 		 505 aa  97.8  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  31.94 
 
 		 458 aa  94.4  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  31.7 
 
 		 480 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  28.77 
 
 		 281 aa  92.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  27.76 
 
 		 545 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  50.59 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  36.71 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  26.69 
 
 		 529 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  41.25 
 
 		 334 aa  60.1  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  36.25 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 328 aa  57  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 328 aa  57  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 307 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  36.71 
 
 		 458 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 		 321 aa  52.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  32.93 
 
 		 363 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 340 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 340 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  37.76 
 
 		 356 aa  52.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 363 aa  52  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  34.18 
 
 		 378 aa  51.6  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 318 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 340 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  33.88 
 
 		 533 aa  50.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  30.08 
 
 		 380 aa  49.7  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 		 389 aa  49.7  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 313 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 291 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  33.75 
 
 		 330 aa  47.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  32.37 
 
 		 246 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 341 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 347 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  32.04 
 
 		 360 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 343 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  30.73 
 
 		 360 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  45.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 		 198 aa  44.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>