29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1720 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
198 aa  390  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  36.14 
 
 
533 aa  68.6  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  38.16 
 
 
356 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  36 
 
 
378 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  34.67 
 
 
281 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  34.67 
 
 
727 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0609  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
234 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  27.59 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  31.17 
 
 
1079 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  27.85 
 
 
428 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 
276 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  26.97 
 
 
966 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  31.17 
 
 
1108 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  30.67 
 
 
545 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  29.35 
 
 
236 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 
328 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  34.25 
 
 
328 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
993 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  25.83 
 
 
277 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  29.51 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  30.77 
 
 
990 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  28.26 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  30.26 
 
 
911 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  30.67 
 
 
480 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  32 
 
 
481 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  30.67 
 
 
470 aa  42  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  28 
 
 
505 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  29.49 
 
 
978 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>