33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0903 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  613  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  77.44 
 
 		 328 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  77.44 
 
 		 328 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  44.37 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  45.57 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  39.66 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  39.52 
 
 		 389 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  37.41 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  26.61 
 
 		 966 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  42.11 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  26.76 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  25.77 
 
 		 990 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  37.66 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  41.89 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  35.06 
 
 		 467 aa  49.3  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  25.77 
 
 		 978 aa  49.3  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0790  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.43 
 
 		 489 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5343  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.84 
 
 		 494 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  35.44 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  26.41 
 
 		 727 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  35.37 
 
 		 364 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  28.81 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5267  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.49 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4800  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.49 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  31.08 
 
 		 498 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2796  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.23 
 
 		 558 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204271  normal  0.530411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2257  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.73 
 
 		 503 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.53676  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  30 
 
 		 470 aa  42.7  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  29.49 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  32.47 
 
 		 356 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>