25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3123 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  45.21 
 
 
389 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  41.46 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  35.53 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  26.9 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  26.26 
 
 
277 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  33.77 
 
 
318 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  33.77 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  33.77 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0604  sporulation domain-containing protein  33.75 
 
 
397 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  33.33 
 
 
467 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  26.67 
 
 
314 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  28.39 
 
 
1079 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  32.89 
 
 
498 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2420  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.57 
 
 
586 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0202661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  37.21 
 
 
993 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  35.96 
 
 
990 aa  45.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  29.95 
 
 
472 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  31.13 
 
 
966 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  34.86 
 
 
474 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  29.44 
 
 
472 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  34.83 
 
 
978 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2257  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.26 
 
 
503 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.53676  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  30.67 
 
 
1108 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  27.72 
 
 
545 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>