90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0604 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0604  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 397 aa  754    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  35.35 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  33.74 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.04 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 620 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  43.27 
 
 		 713 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.24 
 
 		 282 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  34.15 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 268 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.41 
 
 		 620 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  39.09 
 
 		 260 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3493  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 259 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234814  normal  0.110605 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  30.07 
 
 		 277 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 285 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  32.17 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 		 249 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 		 249 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 635 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 635 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.03 
 
 		 254 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 612 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  36.43 
 
 		 262 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  34.18 
 
 		 273 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  32.43 
 
 		 892 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 636 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  46.55 
 
 		 273 aa  49.7  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 886 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 927 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 611 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 917 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 4079 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.33 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  32.45 
 
 		 281 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 715 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.71 
 
 		 190 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  39.81 
 
 		 626 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 283 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 375 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 614 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 614 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  39.81 
 
 		 614 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 614 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  39.81 
 
 		 614 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  39.81 
 
 		 626 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 639 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  32.95 
 
 		 918 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  41.58 
 
 		 649 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  41.58 
 
 		 649 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.09 
 
 		 623 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  39.81 
 
 		 626 aa  46.6  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 201 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  31.68 
 
 		 767 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  30.88 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 542 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  41.38 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  41.38 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  46.77 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.77 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  39.34 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1404 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 562 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.56 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 2240 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 269 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.1 
 
 		 745 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  37.35 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 637 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.69 
 
 		 686 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 615 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  26.83 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.3 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.193028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 		 264 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 207 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 1737 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  35.9 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 		 689 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  43.55 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 883 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  35.9 
 
 		 307 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 		 295 aa  43.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  34.52 
 
 		 330 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 		 836 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>