20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1508 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  43.44 
 
 
311 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  37.32 
 
 
314 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  37.89 
 
 
328 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  37.89 
 
 
328 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 
318 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  36.67 
 
 
389 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  41.67 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  33.77 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  37.18 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  39.47 
 
 
428 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  31.51 
 
 
273 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 
334 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  34.48 
 
 
276 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  25.45 
 
 
990 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  25.58 
 
 
277 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  40.54 
 
 
396 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  34.18 
 
 
242 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  25.07 
 
 
978 aa  42.7  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>