More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3068 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 428 aa  855    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.65 
 
 		 1022 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.99 
 
 		 988 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.75 
 
 		 1056 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  35.5 
 
 		 750 aa  86.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.88 
 
 		 1056 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.88 
 
 		 818 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.44 
 
 		 784 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.44 
 
 		 820 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  32.29 
 
 		 581 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.73 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 878 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  30.77 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  31.98 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.51 
 
 		 839 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.96 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.1 
 
 		 810 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1421 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 361 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.74 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  41.35 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1094 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.8 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  39.8 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 593 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.9 
 
 		 706 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  32.99 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  35.53 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 3145 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  33.77 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 		 746 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 687 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  34.97 
 
 		 233 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30 
 
 		 661 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  31.33 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.78 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  30.6 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 637 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2464  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 4489 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.01 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 1737 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.34 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  43.37 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.28 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 3172 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 		 1694 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  27.32 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 927 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3839  TPR repeat-containing protein  44.58 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.88 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  28.19 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.61 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  36.67 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  42.11 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18241  hypothetical protein  32.2 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.219981  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  32.27 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  35.04 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 291 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>