40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1778 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  28.61 
 
 		 990 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  28.66 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  28.32 
 
 		 978 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  27.93 
 
 		 993 aa  86.3  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  29.07 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  50 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  23.42 
 
 		 835 aa  73.2  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  26.42 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  41.25 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  35.24 
 
 		 545 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  37.63 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  34.82 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  37.5 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  28.79 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  33.33 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  38.16 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  35.29 
 
 		 1079 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  35.53 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  39.25 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  34.94 
 
 		 1108 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  26 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.32 
 
 		 2449 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  25.56 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 529 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  25.73 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  33.77 
 
 		 727 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  30.23 
 
 		 467 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  26.17 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  31.25 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  37.66 
 
 		 378 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.82 
 
 		 1888 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  25.94 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 		 966 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1090  hypothetical protein  38.82 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5687  adenine deaminase  41.18 
 
 		 667 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  32 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  37.5 
 
 		 848 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  40.65 
 
 		 497 aa  44.3  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2420  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.55 
 
 		 586 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0202661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>