46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3023 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  33.75 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  28.57 
 
 		 990 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  28.57 
 
 		 978 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  51.22 
 
 		 334 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  30.96 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  39.25 
 
 		 545 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  47.62 
 
 		 356 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  43.82 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  42.86 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  43.9 
 
 		 470 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  40 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 		 966 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  38.37 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  41.12 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  48.68 
 
 		 1108 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  48.68 
 
 		 1079 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  36.56 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  42.31 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  35.35 
 
 		 727 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  36.84 
 
 		 911 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  43.02 
 
 		 458 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  36.08 
 
 		 463 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  41.67 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  35.9 
 
 		 468 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  35.45 
 
 		 472 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  41.89 
 
 		 458 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  33.65 
 
 		 472 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  35.45 
 
 		 474 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  29.68 
 
 		 440 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  30.86 
 
 		 835 aa  48.9  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  25.93 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  25.91 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  33.33 
 
 		 467 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  32.91 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  23.49 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  23.49 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  32.89 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  31.25 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  34.44 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1090  hypothetical protein  39.47 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  28.07 
 
 		 498 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>