34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1759 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  100 
 
 		 481 aa  957    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  72.56 
 
 		 470 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  50.2 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  45.37 
 
 		 545 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  44.69 
 
 		 535 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  48.12 
 
 		 505 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  43.92 
 
 		 529 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 281 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  30.65 
 
 		 474 aa  106  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 		 966 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  30.37 
 
 		 993 aa  100  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  30.42 
 
 		 990 aa  93.2  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  31.45 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  30.22 
 
 		 911 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  29.94 
 
 		 978 aa  90.9  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  30.64 
 
 		 472 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  30.03 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  48.78 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  42.35 
 
 		 1079 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  43.82 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  39.51 
 
 		 1108 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  40.51 
 
 		 727 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  35.19 
 
 		 835 aa  63.9  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  39.08 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  25.96 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  31.52 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  30.11 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  32.53 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  37.04 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  27.01 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  30.22 
 
 		 237 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  26.83 
 
 		 378 aa  47  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  36 
 
 		 243 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>