34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1467 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  31.19 
 
 
277 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
472 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
472 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  29.82 
 
 
474 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  31.4 
 
 
463 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1371  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  36.56 
 
 
465 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  30.39 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0609  sporulation domain-containing protein  31.58 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  27.13 
 
 
529 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  27.59 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  30.68 
 
 
470 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  31.09 
 
 
545 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  31.03 
 
 
458 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  31.08 
 
 
533 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  29.07 
 
 
468 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  28.32 
 
 
480 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  25.26 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  26.25 
 
 
308 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  30.16 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 
389 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  26.58 
 
 
1108 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  33.77 
 
 
481 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  26.58 
 
 
1079 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0614  sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  29.87 
 
 
505 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  26.51 
 
 
467 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  27.85 
 
 
535 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  33.01 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  27.4 
 
 
342 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  42.59 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  42.59 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  24.51 
 
 
314 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  29.11 
 
 
321 aa  41.6  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>