45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2749 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  100 
 
 		 505 aa  992    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  70.5 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  57.6 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  47.85 
 
 		 481 aa  350  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  51.05 
 
 		 480 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  42.54 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  43.63 
 
 		 529 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  35.12 
 
 		 281 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  29.64 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  28.03 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  28.16 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  30.21 
 
 		 966 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  32.96 
 
 		 993 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  33.54 
 
 		 911 aa  93.6  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  29.65 
 
 		 990 aa  91.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  27.94 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  29.36 
 
 		 978 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  30.98 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  45.45 
 
 		 1079 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  47.5 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  44.44 
 
 		 1108 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  27.16 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  43.75 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  27.25 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  35.79 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  43.84 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  35.29 
 
 		 835 aa  60.5  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  38.27 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  31.52 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  39.53 
 
 		 243 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  29.87 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  28.74 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2393  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.03 
 
 		 573 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0818028  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 340 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 340 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  29.55 
 
 		 292 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  29.89 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 340 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  29.87 
 
 		 237 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 328 aa  43.5  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 328 aa  43.5  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>