40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2179 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  100 
 
 		 468 aa  913    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  75.37 
 
 		 463 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  49.1 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  47.28 
 
 		 472 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  47.08 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  46.84 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  31.39 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  31.19 
 
 		 511 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  30.21 
 
 		 990 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  30.48 
 
 		 966 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  29.91 
 
 		 978 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  29.2 
 
 		 1079 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  31.12 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  30.03 
 
 		 727 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  28.7 
 
 		 911 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  27.94 
 
 		 1108 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  30.22 
 
 		 993 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  29.2 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  27.94 
 
 		 481 aa  86.7  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  28.12 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  40 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  30.69 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  32.93 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  35.9 
 
 		 276 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  36.99 
 
 		 533 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  32.61 
 
 		 529 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  29.07 
 
 		 237 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0790  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.87 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 307 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  35 
 
 		 194 aa  44.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 321 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 340 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  27.4 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  30.69 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>