38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4421 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1050    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  39.25 
 
 		 545 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  39.27 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  39.54 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  39.2 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  41.3 
 
 		 480 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  38.13 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  33.23 
 
 		 281 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  30.81 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  29.87 
 
 		 472 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  28 
 
 		 472 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  27.27 
 
 		 468 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  31.25 
 
 		 990 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  31.34 
 
 		 978 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  28.45 
 
 		 993 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  27.48 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  29.62 
 
 		 911 aa  67  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  28.81 
 
 		 966 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  38.55 
 
 		 1079 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  40.51 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  39.24 
 
 		 1108 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  42.31 
 
 		 727 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  37.21 
 
 		 458 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  39.47 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  37.04 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  20.34 
 
 		 835 aa  51.6  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  29.21 
 
 		 237 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  30.94 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  26.53 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 340 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  25.3 
 
 		 363 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  25.32 
 
 		 363 aa  47  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2420  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.6 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0202661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  28.7 
 
 		 321 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  25.32 
 
 		 340 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  27.55 
 
 		 330 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2393  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.79 
 
 		 573 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0818028  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  27.5 
 
 		 340 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>