54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1812 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  100 
 
 
727 aa  1437    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  33.91 
 
 
990 aa  218  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  33.72 
 
 
978 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  39.89 
 
 
993 aa  204  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  38.89 
 
 
966 aa  197  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  37.05 
 
 
911 aa  158  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  31.63 
 
 
1079 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.47 
 
 
835 aa  106  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  30.14 
 
 
474 aa  103  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  29.7 
 
 
463 aa  102  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  30.68 
 
 
472 aa  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  30.28 
 
 
472 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  30.15 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  42.86 
 
 
505 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  26.02 
 
 
511 aa  79  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  30.33 
 
 
1108 aa  77.4  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  42.31 
 
 
535 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  39.47 
 
 
480 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  39.42 
 
 
545 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  40.51 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  30.82 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  26.26 
 
 
281 aa  64.7  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  37.63 
 
 
470 aa  64.3  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  40.74 
 
 
529 aa  61.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 
363 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 
321 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  35.35 
 
 
276 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  28.4 
 
 
468 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  30.17 
 
 
318 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  36.14 
 
 
328 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  36.14 
 
 
328 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 
307 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
363 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 
340 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 
340 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  34.86 
 
 
533 aa  54.7  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 
291 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  32.26 
 
 
356 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
340 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  33.77 
 
 
334 aa  51.6  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  34.67 
 
 
198 aa  51.2  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 
341 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  27.56 
 
 
313 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  26.61 
 
 
359 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  28.75 
 
 
380 aa  48.5  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  27.27 
 
 
299 aa  48.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  28.75 
 
 
343 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  27.5 
 
 
291 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.75 
 
 
347 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  28.75 
 
 
330 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 
303 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  32.47 
 
 
467 aa  45.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  34.94 
 
 
260 aa  44.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  29.29 
 
 
286 aa  43.9  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>